MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aeropyrum camini SY1 = JCM 12091 DNA

Total Repeats: 35929

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022521	TCC	2	6	168020	168025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454810
3502	NC_022521	GGA	2	6	168110	168115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454810
3503	NC_022521	CTG	2	6	168181	168186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454810
3504	NC_022521	ACCCT	2	10	168214	168223	20 %	20 %	0 %	60 %	549454811
3505	NC_022521	GCC	2	6	168295	168300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454811
3506	NC_022521	CCG	2	6	168401	168406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454811
3507	NC_022521	GCT	2	6	168410	168415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454811
3508	NC_022521	CAGG	2	8	168444	168451	25 %	0 %	50 %	25 %	549454811
3509	NC_022521	CTC	2	6	168494	168499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454811
3510	NC_022521	CTA	2	6	168558	168563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454811
3511	NC_022521	CTACCC	2	12	168575	168586	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	549454811
3512	NC_022521	C	6	6	168584	168589	0 %	0 %	0 %	100 %	549454811
3513	NC_022521	CGA	2	6	168606	168611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454811
3514	NC_022521	GAG	2	6	168614	168619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454811
3515	NC_022521	CTC	2	6	168641	168646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454811
3516	NC_022521	G	6	6	168684	168689	0 %	0 %	100 %	0 %	549454811
3517	NC_022521	CCA	2	6	168798	168803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549454811
3518	NC_022521	GAG	2	6	168838	168843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454811
3519	NC_022521	GGC	2	6	168853	168858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454811
3520	NC_022521	CAC	2	6	168901	168906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549454811
3521	NC_022521	CTC	2	6	168951	168956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454811
3522	NC_022521	AGA	2	6	168977	168982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549454811
3523	NC_022521	GCCT	2	8	169002	169009	0 %	25 %	25 %	50 %	549454811
3524	NC_022521	CAG	2	6	169051	169056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454811
3525	NC_022521	AAC	2	6	169081	169086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549454811
3526	NC_022521	CTC	2	6	169156	169161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454811
3527	NC_022521	AGT	2	6	169235	169240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454811
3528	NC_022521	AG	3	6	169244	169249	50 %	0 %	50 %	0 %	549454811
3529	NC_022521	GTT	2	6	169271	169276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549454811
3530	NC_022521	CTT	2	6	169294	169299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549454811
3531	NC_022521	CCT	2	6	169470	169475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454811
3532	NC_022521	CTT	2	6	169505	169510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549454811
3533	NC_022521	GAGAG	2	10	169511	169520	40 %	0 %	60 %	0 %	549454811
3534	NC_022521	TA	3	6	169545	169550	50 %	50 %	0 %	0 %	549454811
3535	NC_022521	CGC	3	9	169558	169566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454811
3536	NC_022521	AAT	2	6	169576	169581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549454811
3537	NC_022521	CAA	2	6	169623	169628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_022521	AGCCTA	2	12	169645	169656	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	549454812
3539	NC_022521	CCT	2	6	169660	169665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454812
3540	NC_022521	CAG	2	6	169668	169673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454812
3541	NC_022521	CTG	2	6	169685	169690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454812
3542	NC_022521	CTA	2	6	169694	169699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454812
3543	NC_022521	GTA	2	6	169700	169705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454812
3544	NC_022521	TA	3	6	169731	169736	50 %	50 %	0 %	0 %	549454812
3545	NC_022521	ATC	2	6	169747	169752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454812
3546	NC_022521	GCC	2	6	169813	169818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454812
3547	NC_022521	ACT	2	6	169864	169869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454812
3548	NC_022521	CCCG	2	8	169905	169912	0 %	0 %	25 %	75 %	549454812
3549	NC_022521	CCAG	2	8	169988	169995	25 %	0 %	25 %	50 %	549454812
3550	NC_022521	C	6	6	170054	170059	0 %	0 %	0 %	100 %	549454812
3551	NC_022521	CCG	2	6	170069	170074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454812
3552	NC_022521	CCA	2	6	170168	170173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549454812
3553	NC_022521	TAGC	2	8	170296	170303	25 %	25 %	25 %	25 %	549454812
3554	NC_022521	CCT	2	6	170306	170311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454812
3555	NC_022521	CTC	2	6	170312	170317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454812
3556	NC_022521	GCT	2	6	170355	170360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454812
3557	NC_022521	GGCT	2	8	170499	170506	0 %	25 %	50 %	25 %	549454812
3558	NC_022521	AGCC	2	8	170508	170515	25 %	0 %	25 %	50 %	549454812
3559	NC_022521	AGG	2	6	170533	170538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454812
3560	NC_022521	AGG	2	6	170551	170556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454812
3561	NC_022521	CGA	2	6	170600	170605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454812
3562	NC_022521	GGC	2	6	170724	170729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454812
3563	NC_022521	GCG	2	6	170737	170742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454812
3564	NC_022521	GAG	2	6	170745	170750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454812
3565	NC_022521	TAG	2	6	170784	170789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454812
3566	NC_022521	AG	3	6	170813	170818	50 %	0 %	50 %	0 %	549454812
3567	NC_022521	GCA	2	6	170821	170826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454812
3568	NC_022521	AG	3	6	170837	170842	50 %	0 %	50 %	0 %	549454812
3569	NC_022521	CCG	2	6	170843	170848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454812
3570	NC_022521	GCG	2	6	170908	170913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454812
3571	NC_022521	GAG	2	6	170961	170966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454812
3572	NC_022521	ACT	2	6	170989	170994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454813
3573	NC_022521	GCCA	2	8	171069	171076	25 %	0 %	25 %	50 %	549454813
3574	NC_022521	GAG	2	6	171132	171137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454813
3575	NC_022521	AGG	2	6	171180	171185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454813
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3577	NC_022521	CGG	2	6	171283	171288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_022521	G	6	6	171336	171341	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_022521	TGGT	2	8	171367	171374	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_022521	CCT	2	6	171428	171433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454814
3581	NC_022521	TG	3	6	171535	171540	0 %	50 %	50 %	0 %	549454814
3582	NC_022521	TA	3	6	171654	171659	50 %	50 %	0 %	0 %	549454814
3583	NC_022521	G	6	6	171695	171700	0 %	0 %	100 %	0 %	549454814
3584	NC_022521	CTC	2	6	171729	171734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454814
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3586	NC_022521	TCT	2	6	171887	171892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549454814
3587	NC_022521	TCC	2	6	171901	171906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454814
3588	NC_022521	CTT	2	6	171942	171947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549454814
3589	NC_022521	CT	3	6	171989	171994	0 %	50 %	0 %	50 %	549454814
3590	NC_022521	CTA	2	6	172052	172057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454814
3591	NC_022521	TA	3	6	172083	172088	50 %	50 %	0 %	0 %	549454814
3592	NC_022521	TG	3	6	172090	172095	0 %	50 %	50 %	0 %	549454814
3593	NC_022521	GCTC	2	8	172106	172113	0 %	25 %	25 %	50 %	549454814
3594	NC_022521	CT	3	6	172266	172271	0 %	50 %	0 %	50 %	549454814
3595	NC_022521	TA	3	6	172304	172309	50 %	50 %	0 %	0 %	549454814
3596	NC_022521	TA	3	6	172385	172390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_022521	GA	3	6	172408	172413	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_022521	TGG	2	6	172418	172423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_022521	GGT	2	6	172433	172438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_022521	GAG	2	6	172481	172486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_022521	AGC	2	6	172494	172499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_022521	AAT	2	6	172618	172623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_022521	CTA	2	6	172644	172649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_022521	GCC	2	6	172723	172728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454815
3605	NC_022521	AGG	2	6	172733	172738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454815
3606	NC_022521	GTAG	2	8	172823	172830	25 %	25 %	50 %	0 %	549454815
3607	NC_022521	CTC	2	6	172904	172909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454815
3608	NC_022521	TCC	2	6	172914	172919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454815
3609	NC_022521	AAG	2	6	172949	172954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549454815
3610	NC_022521	GCA	2	6	173109	173114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454815
3611	NC_022521	GA	3	6	173204	173209	50 %	0 %	50 %	0 %	549454815
3612	NC_022521	G	6	6	173217	173222	0 %	0 %	100 %	0 %	549454815
3613	NC_022521	TGA	2	6	173263	173268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454815
3614	NC_022521	GGT	2	6	173269	173274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549454815
3615	NC_022521	GT	3	6	173325	173330	0 %	50 %	50 %	0 %	549454815
3616	NC_022521	GCCC	2	8	173331	173338	0 %	0 %	25 %	75 %	549454815
3617	NC_022521	G	6	6	173406	173411	0 %	0 %	100 %	0 %	549454815
3618	NC_022521	ACG	2	6	173439	173444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454815
3619	NC_022521	CCA	2	6	173464	173469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549454815
3620	NC_022521	CCACG	2	10	173503	173512	20 %	0 %	20 %	60 %	549454815
3621	NC_022521	CCT	2	6	173644	173649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3622	NC_022521	ATA	2	6	173653	173658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_022521	GAA	2	6	173766	173771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549454816
3624	NC_022521	AAG	2	6	173781	173786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549454816
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3743	NC_022521	ATT	2	6	179950	179955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3744	NC_022521	TCA	2	6	179964	179969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3745	NC_022521	CT	3	6	180014	180019	0 %	50 %	0 %	50 %	549454823
3746	NC_022521	ACC	2	6	180023	180028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549454823
3747	NC_022521	CA	3	6	180113	180118	50 %	0 %	0 %	50 %	549454823
3748	NC_022521	CCT	2	6	180127	180132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454823
3749	NC_022521	TAT	2	6	180151	180156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549454823
3750	NC_022521	CAT	2	6	180238	180243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454823
3751	NC_022521	AAT	2	6	180248	180253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549454823
3752	NC_022521	AAG	2	6	180334	180339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549454823
3753	NC_022521	G	6	6	180362	180367	0 %	0 %	100 %	0 %	549454823
3754	NC_022521	CCT	2	6	180374	180379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454823
3755	NC_022521	GGC	2	6	180421	180426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454823
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3757	NC_022521	CAG	2	6	180607	180612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454823
3758	NC_022521	CAATAC	2	12	180658	180669	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	549454823
3759	NC_022521	GCT	2	6	180702	180707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454823
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3762	NC_022521	CTG	2	6	180771	180776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454823
3763	NC_022521	CGT	2	6	180832	180837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454823
3764	NC_022521	CCCCG	2	10	181033	181042	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
3765	NC_022521	ACC	2	6	181089	181094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549454824
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3767	NC_022521	ACCAT	2	10	181125	181134	40 %	20 %	0 %	40 %	549454824
3768	NC_022521	TC	3	6	181146	181151	0 %	50 %	0 %	50 %	549454824
3769	NC_022521	GAA	2	6	181231	181236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549454824
3770	NC_022521	GCCGAC	2	12	181263	181274	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	549454824
3771	NC_022521	CCT	2	6	181331	181336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454824
3772	NC_022521	CCT	2	6	181357	181362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454824
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3774	NC_022521	CTG	2	6	181398	181403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454824
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3776	NC_022521	CTC	3	9	181499	181507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454824
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3780	NC_022521	CTG	2	6	181708	181713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454824
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3803	NC_022521	GCC	2	6	182491	182496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3820	NC_022521	AT	3	6	183158	183163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3821	NC_022521	TAA	2	6	183193	183198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3832	NC_022521	G	6	6	183650	183655	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3833	NC_022521	TAG	2	6	183680	183685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3835	NC_022521	GCT	2	6	183729	183734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454828
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3849	NC_022521	GT	3	6	184370	184375	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3850	NC_022521	AG	3	6	184440	184445	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3851	NC_022521	GGA	2	6	184483	184488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454829
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3855	NC_022521	G	7	7	184563	184569	0 %	0 %	100 %	0 %	549454829
3856	NC_022521	AGG	2	6	184571	184576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454829
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3858	NC_022521	TAGC	2	8	184626	184633	25 %	25 %	25 %	25 %	549454829
3859	NC_022521	AG	3	6	184673	184678	50 %	0 %	50 %	0 %	549454829
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3864	NC_022521	ATG	2	6	184768	184773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454829
3865	NC_022521	TGAGG	2	10	184822	184831	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3866	NC_022521	CCT	2	6	184877	184882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3867	NC_022521	GTC	2	6	184886	184891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3868	NC_022521	TGCGT	2	10	184939	184948	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3869	NC_022521	GC	3	6	185162	185167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3870	NC_022521	TA	3	6	185209	185214	50 %	50 %	0 %	0 %	549454830
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3880	NC_022521	AT	3	6	185671	185676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3882	NC_022521	AGTG	2	8	185823	185830	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3994	NC_022521	CGG	2	6	191078	191083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454835
3995	NC_022521	ACT	2	6	191117	191122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454835
3996	NC_022521	GCC	2	6	191139	191144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454835
3997	NC_022521	GGGA	2	8	191202	191209	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3998	NC_022521	CCCTCC	2	12	191258	191269	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	549454836
3999	NC_022521	C	6	6	191314	191319	0 %	0 %	0 %	100 %	549454836
4000	NC_022521	CT	3	6	191514	191519	0 %	50 %	0 %	50 %	549454836

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